Vlaky linek S3 a R3 budou kvůli výluce ve směru od Mladé Boleslavi zkráceny do Neratovic, linka S34 bude zrušena úplně. Její provoz dráhy v omezeném rozsahu obnoví 20. května. Mezi Prahou a Neratovicemi bude zavedena náhradní autobusová doprava X-S3.
Autobusy, které nahradí linku S3 budou vyjíždět z Hlavního nádraží a budou zastavovat v zastávkách Letňany, Fryčovická, Cukrovar Čakovice a až do Neratovic pak na zastávkách poblíž vlakových nádraží. Vybrané večerní autobusy pojedou navíc přes Satalice a Kbely.
Po dobu výluky nahradí rychlíky R3 rovněž autobusy, které budou vyjíždět buď z Hlavního nádraží, nebo z Vysočan. Ve směru Hlavní nádraží navíc autobusy zastaví také v zastávkách Jankovcova a Vltavská.