Holoubek se narodil 11. dubna 1951 v Brně. Po studiu na střední škole se zaměřením na chemii absolvoval Přírodovědeckou fakultu dnešní Masarykovy univerzity. Na Karlově univerzitě se poté věnoval ekologii.
Aktivně se podílel na založení Katedry ochrany a tvorby životního prostředí na Přírodovědecké fakultě MU v roce 1983. Tedy ještě za komunistického režimu, který těmto aktivitám nijak nepřál.
Po krátké nemoci zemřel Vojtěch Adam, který měl být rektorem. Bylo mu 42 let |
V roce 1990 bylo toto pracoviště transformováno na Katedru chemie životního prostředí a ekotoxikologie, z níž vzniklo v roce 1994 Centrum pro výzkum toxických látek v prostředí (RECETOX). Holoubek jej vedl téměř čtvrt století jako ředitel a aktivně se podílel na implementaci Stockholmské úmluvy zaměřené na ochranu lidského zdraví před účinky škodlivých látek.
Ivan Holoubek byl jedním ze zakladatelů centra Recetox spadajícího pod Masarykovu univerzitu, které se zabývá environmentálními a zdravotními riziky souvisejícími s chemickými látkami.
Upozorňoval mimo jiné na problém s nespotřebovanými pesticidy. „Začali jsme používat látky, o kterých jsme nevěděli, co v prostředí způsobí. Ilegální skládky jsou po celé planetě a řada míst je pesticidy zamořena. Dlouhodobě sledujeme koncentrace těchto škodlivých látek v ovzduší, půdách, v usazeninách v rybnících a podobně,“ popisoval v rozhovoru pro iDNES.cz. Zmínil, že v Česku jsou takto zamořené i některé památky, třeba hrad Buchlov nebo barokní divadlo v Českém Krumlově.
Přítomnost nebezpečných toxických látek ve vzduchu zkoumal také v Africe. „Kvůli koloběhu vody a větrnému proudění se tyto látky přenášejí na velké vzdálenosti. Objevují se pak v tělech dravých ryb u kanadských břehů nebo ledních medvědů na Špicberkách, přestože se tam tyto látky nikdy nevyráběly,“ poznamenal Holoubek.
Ten v roce 2016 dostal Cenu města Brna kromě jiného za to, že jeho aktivity přiváděly stovky zahraničních účastníků konferencí a díky tradici mezinárodních letních škol přijely i tisíce mladých vědců.
Významná byla i Holoubkova pedagogická činnost. Na přírodovědecké fakultě působil až dosud, vyučoval předmět Politika a strategie ochrany prostředí před chemickým znečištěním.
