Přítomnost konkrétních bakterií ve střevech může signalizovat rozvoj kolorektálního karcinomu. Nasvědčují tomu výsledky studie zveřejněné časopisem Nature Medicine. Mezinárodní tým koordinovala Univerzita v Trentu v Itálii a tvořili jej také odborníci z Česka. Vědci chtějí poznatky dále využít při vývoji neinvazivních metod pro včasné odhalení rakoviny tlustého střeva a konečníku. Test ze stolice by jednou mohl být alternativou ke kolonoskopii, informovala dnes v tiskové zprávě brněnská Masarykova univerzita.
Vědci nově sekvenovali více než 1600 vzorků od různých skupin pacientů, takzvaných kohort, včetně těch z Česka. "Naše COLOBIOME kohorta nabízí jednu z nejkomplexnějších klinických sad dat s podrobným určením rozsahu a stadia onemocnění u více než 200 pacientů. Studie COLOBIOME vznikla díky českému financování a spolupráci s Masarykovým onkologickým ústavem a jsem ráda, že mohla přispět k mezinárodnímu pokroku v oblasti screeningu rakoviny," uvedla Eva Budinská z ústavu RECETOX Přírodovědecké fakulty Masarykovy univerzity.
Další vzorky pochází z kohorty, kterou koordinuje Ústav experimentální medicíny Akademie věd ČR s Univerzitou Karlovou a Italským institutem pro genomickou medicínu. Společně tak obě české skupiny představují největší národní podíl v nových výzkumných datech. "Studie ukazuje, jak důležité je dlouhodobé investování do biobank," uvedl ředitel Banky biologického materiálu Masarykova onkologického ústavu v Brně Roman Hrstka.
Mezinárodní tým také přišel s novou metodologií založenou na strojovém učení. "Tato technologie propojená s metagenomickými analytickými přístupy, které používáme v naší laboratoři, umožňuje vytvoření prediktivního modelu, který určí, zda má daný jedinec vysokou pravděpodobnost výskytu kolorektálního karcinomu," uvedl hlavní řešitel Nicola Segata z Univerzity v Trentu.
Otázkou pro další výzkum je to, zda jsou některé z mikrobiálních druhů či kmenů jen signálem nemoci, nebo hrají kauzální roli při vzniku nádoru. Souvislost mezi mikrobiomem a vznikem rakoviny tlustého střeva a konečníku vědci zkoumají už několik let. Některé konkrétní bakterie totiž mají schopnost narušovat buněčné procesy v těle, a mohou tak postupně přispívat k rozvoji nádorů.
