Podle dnešního vydání deníku Právo policie spolu s Benešovou stíhá i šéfa správní rady školy Petra Haluzu a ženu, která měla peníze od univerzity získat. Benešová byla v listopadu 2011 odsouzena k dvouletému podmínečnému trestu za korupci a zpronevěru. Prezident Václav Klaus ji však omilostnil, za což si vysloužil tvrdou kritiku od lidí, kteří poukazovali na úzké kontakty Benešové s tehdejší první dámou. Benešová tehdy nicméně rezolutně popřela, že by se tato obvinění zakládala na pravdě. Prohlásila, že se s Livií Klausovou setkala jen příležitostně.